Новое исследование показало, что тестирование одной молекулы иммунной системы в мазках из носа может помочь обнаружить скрытые вирусы

Как показала пандемия COVID-19, потенциально опасные новые вирусы могут начать распространяться среди населения задолго до того, как глобальная система надзора за здоровьем населения сможет их обнаружить.

Однако исследователи из Йельского университета обнаружили, что тестирование на наличие одной молекулы иммунной системы в мазках из носа может помочь обнаружить скрытые вирусы, которые не идентифицируются стандартными тестами, сообщают они в журнале Lancet Microbe.

«Найти новый опасный вирус — это как искать иголку в стоге сена», — сказала Эллен Фоксман, доцент кафедры лабораторной медицины и иммунобиологии и старший автор исследования. «Мы нашли способ значительно уменьшить размер стога сена».

Чиновники общественного здравоохранения обычно обращаются к нескольким источникам для предупреждающих признаков новой болезни. Они изучают новые вирусы у животных, которые могут передавать инфекцию людям. Но определить, какой из сотен или тысяч новых вирусных вариантов представляет истинную опасность, сложно. И они ищут вспышки необъяснимых респираторных заболеваний, как это было, когда SARS-Cov-2, вирус, вызывающий COVID-19, был обнаружен в Китае в конце 2019 года.

Однако к тому времени, когда произойдет вспышка нового вируса, сдержать его распространение может быть уже слишком поздно.

Для нового исследования Фоксман и ее команда пересмотрели наблюдение, сделанное в ее лаборатории в 2017 году, которое, по их мнению, может предоставить новый способ мониторинга неожиданных патогенов. Мазки из носа обычно берутся у пациентов с подозрением на респираторные инфекции и тестируются на выявление специфических сигнатур от 10 до 15 известных вирусов. Большинство тестов возвращаются отрицательными. Но, как заметила команда Фоксман в 2017 году, в нескольких случаях мазки тех, кто дал отрицательный результат на «обычные подозреваемые» вирусы, все еще демонстрировали признаки того, что противовирусная защита была активирована, что указывало на присутствие вируса. Контрольным признаком был высокий уровень одного противовирусного белка, вырабатываемого клетками, выстилающими носовые ходы.

Основываясь на этом открытии, исследователи применили комплексные методы генетического секвенирования к старым образцам, содержащим белок, и в одном из образцов обнаружили неожиданный вирус гриппа, названный гриппом С.

Исследователи также использовали эту же стратегию повторного тестирования старых образцов для поиска пропущенных случаев COVID-19 в течение первых двух недель марта 2020 года. Хотя случаи вируса появились в штате Нью-Йорк примерно в то же время, тестирование стало доступно только через несколько недель. Сотни образцов мазков из носа, собранных у пациентов в больнице Йель-Нью-Хейвен в то время, дали отрицательный результат на стандартные сигнатурные вирусы. При тестировании на биомаркер иммунной системы подавляющее большинство этих образцов не показало никаких следов активности противовирусной системы защиты. Но некоторые показали; среди них команда обнаружила четыре случая COVID-19, которые на тот момент остались недиагностированными.

Результаты показывают, что тестирование на противовирусный белок, вырабатываемый организмом, даже если тесты на известные респираторные вирусы отрицательные, может помочь определить, какие мазки из носа с большей вероятностью содержат неожиданные вирусы.

В частности, скрининг на биомаркер может позволить исследователям сузить поиск неожиданных патогенов, что делает возможным наблюдение за неожиданными вирусами с использованием мазков, собранных во время обычного ухода за пациентами. Образцы, в которых обнаружен биомаркер, можно анализировать с использованием более сложных методов генетического тестирования для выявления неожиданных или новых патогенов, циркулирующих в популяции пациентов, и инициировать ответ со стороны медицинского сообщества.

— Этот пресс-релиз был первоначально опубликован на сайте Йельского университета.